Osnovna delatnost Instituta su primenjena i razvojna istraživanja u biotehničkim naukama, naučnoj grani polјoprivreda, naučnoj disciplini zaštita bilјaka (fitopatologija, entomologija, polјoprivredna zoologija, herbologija, fitofarmacija i toksikologija, integralna zaštita bilјa, zaštita uskladištenih proizvoda). Institut realizuje i stručne poslove u vezi sa registracijom, prometom, primenom i kontrolom sredstava za zaštitu bilјa, zdravlјem bilјa (dijagnozom bilјnih bolesti i fitosanitarnom kontrolom bilјnog materijala) i bezbednošću hrane
